云助推器主题研究

概览

在信息与网络技术的推动下,大量从宏观到微观、从自然到社会的观察、感知、计算、仿真、模拟、传播等设施和活动产生出大量科学数据,形成被称为“大数据”的新的科学基础设施。数据不再仅仅是科学研究的结果,而是变成科学研究的基础。Microsoft Azure for Research 是微软研究院推出的科研计划。此计划目标在于帮助科研人员利用云平台来推动科学研究。微软研究院希望通过该计划支持科学界建立并使用基于云的数据收集、分析工具、从此来推动创造新的科研发现,并进一步提出云计算平台应用的创新性方案。

内容

随着海量数据的处理及交叉多学科合作的需求不断增长,使得将计算移动到Microsoft Azure云计算平台非常具有吸引力。同时也有许多的科研人员通过Microsoft Azure云计算平台,从云的灵活性、方便性、稳定性中获益匪浅。

大肠癌病理切片医学图像数字化处理研究

许燕 北京航空航天大学 来茂德 中国药科大学 张益肇、屠卓文 微软亚洲研究院

癌症的诊断是全世界医学专家攻克的难题。PET、CT、MRI等影像技术已被广泛的使用在癌症的诊断中。然而,在临床中病理医生根据组织切片所给出的病理报告才是判断癌症的金标准(Golden Standard)。

微软亚洲研究院的张益肇博士、屠卓文博士,北京航空航天大学生物医学工程的博士与中国药科大学校长,中华医学会病理学分会主任委员来茂德教授合作以大肠癌为切入点开展病理切片数字化处理的研究。大尺度的病理切片图像,单机不可能完成图像分析的工作,给出癌症诊断的结果。云计算平台则为研究的进行提供了巨大的存储空间和快捷的计算资源,项目已经计算部署到Microsoft Azure上实现并行运算,提高了运算效率——将计算部署到128个节点上(每个计算节点为2.43G的八核处理器),处理6TB的肠癌切片数据共耗时一天左右(25小时)。计算机的结果接近了医生的诊断结果,达到了临床运用的价值。

基于生物多样性文献数据绘制物种历史分布图研究

许哲平 中国科学院

2012年,微软和国际自然保护组织(IUCN)在韩国召开的世界自然保护大会上共同宣布要建立一种新的合作伙伴关系来进一步完善IUCN关于濒危生物红色名录上的信息。这能使用户更好查询和定位面临某种威胁的物种的空间分布信息,从而帮助红色名录的评估过程。然而,还有许多其他的物种仍然需要应用这种功能,并且很多公共用户也需要,尤其是在生物多样性、生态学、林学、农业、渔业和自然保护区领域。如果可以提供历史上分布的动态性,那么对于濒危动物的保护将会非常有意义。

中国科学院植物研究所文献信息中心许哲平博士开展的基于生物多样性文献数据绘制物种历史分布图的研究将尝试从浩瀚如海的有关生物多样性的历史文献中提取出埋藏其中的物种分布信息。为了绘制出物种的历史分布图,首先便需要建立生物多样性的数据库。研究中,Microsoft Azure为储存OCR文本数据和一些处理数据提供了充足的空间,并且在数据的处理和图层的生成中缩短了计算时间,提高了计算效率。

基于Microsoft Azure的陆地生态系统碳水通量估算与不确定性研究

何洪林 中国科学院

工业革命以来人类活动的影响引起了地球系统的一系列变化,比如温室气体排放、气温升高、降水变化等等,已经受到世界各国政府和科学家乃至普通公民的普遍关注。因而,在全球变化的背景下,充分理解全球碳水通量格局及其时空变化机制显得尤为重要,是充分认识生物圈和地球系统的关键。

来自中国科学院地理科学与资源研究所生态系统网络预测与模拟重点实验室的何洪林博士开展了一项基于Microsoft Azure的陆地生态系统碳水通量估算与不确定性的研究,目的是根据Microsoft Azure提供的海量多源异构数据的云存储与数据密集型计算架构,构建一个陆地生态系统碳水通量数据存储、模型模拟及其不确定性分析平台;在该平台之上,运用VPM模型与PT-Fisher模型估算青藏高原草地生态系统碳水通量及其不确定性。

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MicrosoftAzure科研云助推器培训计划

Microsoft Azure科研云助推器培训计划

“科研云助推器培训计划”作为Microsoft Azure for Research 项目的一部分,旨在通过培训课程帮助全球的研究者运用云助推器来推动研究。从2013年起,微软研究院在全球范围内为科研人员免费提供两天的、针对Microsoft Azure云计算平台运用的培训。在培训中,老师们能够亲自体验Microsoft Azure云计算平台的应用设计模式,提升他们利用Microsoft Azure云计算平台运行并维护应用程序或服务的能力。

作为全球培训计划的一部分,自2013年9月起,微软在全球开展了多场云助推器培训计划的活动。10月—12月期间于北京、广州、南京等地举办了多场培训活动。一共有274名不同领域的研究人员参与了这一系列的培训。在“Microsoft Azure科研云助推器培训”的影响下,70多名亚洲科研人员参与了Microsoft Azure Award Program并提交了将Azure云计算平台运用于自己科研领域内的科研提案。

2014年,微软亚洲研究院将继续在台湾、香港及更多中国城市继续举办“Microsoft Azure科研云助推器培训”。我们希望通过这一培训,让更多的科研人员认识并学会使用Microsoft Azure云计算平台,利用Azure去开展科研工作,共同解决科研中面对的大数据带来的挑战与难题。

北京第一次分会场活动图片

微软研究院为参与该培训计划的研究人员提供:

  • 两天的Microsoft Azure技术培训,免费注册,培训将由Microsoft Azure资深专家授课。
  • 参会者将会有6个月免费的Microsoft Azure普通学术账号的体验机会。

经过培训和针对性的案例分析讨论,获得为期一年的大存储和高计算资源Microsoft Azure账号的优先申请权。

参与对象

高校教师、研究生及相关研究人员 (具有一定编程基础)

课程安排(日程将根据全球参与者的反馈情况进行适当的调整)

第一天

09:00 开场
09:20 云计算及Microsoft Azure简介
10:30 动手实验:Microsoft Azure网站入门
11:30 动手实验:Microsoft Azure虚拟机入门
12:00 午餐
13:00 动手实验:虚拟机应用
14:30 Microsoft Azure数据存储
16:00 云服务的理解与使用
17:00 小组讨论
17:15 第一天总结
17:30-19:00 晚餐与小组讨论

 

第二天

09:00 第一天回顾
09:15 示例:使用脚本的扫描分析
09:45 Windows HPC Server 2012 集群
11:00 动手实验:Linux 集群
12:15 午餐
13:15 基于Microsoft Azure的可视化技术
14:45 基于Hadoop,SQL,no-SQL的大数据分析
15:45 Streaming Data
16:45 小组讨论
17:15 第二天总结

 

云助推器教学科研奖励计划

微软面向全球接收来自不同国家和地区的研究计划,入选的研究计划将获得海量Microsoft Azure的资源促进科学研究,并获得为期一年的Microsoft Azure大量存储空间以及计算资源的使用权。

申请者需属于科研机构或非盈利研究实验室。除了个人研究项目外,研究团体、社区也可以申请。研究题目包括但不局限于:自然科学中的云计算应用、数据服务、工具共享、机器学习、城市计算等。

在2013年10月15日截止的第一轮Microsoft Azure for Research的全球项目选拔中,一共有来自15个国家和地区的35份研究计划入选,其中包括5名中国研究者。第二轮的选拔于2013年12月15日截止,全球一共有45份研究计划入选,其中包括8名中国研究者。

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